幻日のヨハネ #12

ライラプスがヨハネとだけ会話して、ほかの登場人物には鳴き声で反応している問題が解決します。ただし、視聴者がそう聞こえただけで、コミュニケーションが取れないわけではないと思うのです。幻日のヨハネにはライラプス以外にも非人間のキャラクターが多くいて、それぞれが登場したとき何を思っているか推察することができます。

それ以外の謎だと、ルビィの変身、ラブライブ世界との関係性の問題があります。